More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5194 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 333 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  91.59 
 
 		 333 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  58.38 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  54.94 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  53.87 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  45.39 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  42.18 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  48.68 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  46.51 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  39.64 
 
 		 337 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  39.48 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  41.19 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  41.39 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  41.06 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  42.67 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  40.91 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  39.6 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  39.6 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  42.47 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  42.14 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  40.74 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  43.38 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  40.89 
 
 		 329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  38.72 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  36.76 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  40.66 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  37.88 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  41.16 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  40.41 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  40.58 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  40.46 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  37.03 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  38.8 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  40.52 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  42.75 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  37.25 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  40.96 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  40.37 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  40.41 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  41.43 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  40.07 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  36.34 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.06 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  36.07 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  34.77 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  33.21 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  38.83 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  38.97 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  33.18 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  32.06 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  32.06 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  32.19 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  32.19 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  30 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  32.19 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  28.46 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  28.46 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  25.49 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  35.11 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  24.8 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  34.62 
 
 		 605 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  35.8 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  29.95 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  31.08 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  30.32 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  24.4 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  33.57 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  31.91 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  26.81 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  35.66 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  32.84 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  31.68 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 572 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  32.45 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  32.68 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  32.45 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  36.56 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  25.93 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  29.89 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  39.33 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  38.32 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  32.5 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.61 
 
 		 274 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  33.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.76 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  33.33 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  37.86 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  30.58 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>