More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1304 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  92.09 
 
 		 393 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  100 
 
 		 393 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  47.12 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  43.2 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  44.24 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  39.1 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  38.89 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.83 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  34.64 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.99 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  36.36 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  34.3 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.7 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  32.74 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  34.49 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.76 
 
 		 391 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  31.9 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  31.58 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.12 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  30.79 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.83 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  29.07 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  30.1 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.37 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  32.04 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.12 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.97 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  27.2 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  27.76 
 
 		 380 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.12 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  31.62 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  31.98 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.07 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.12 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.33 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.7 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.37 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.38 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.69 
 
 		 388 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  32.57 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  30.45 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.39 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.64 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.97 
 
 		 409 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.77 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.73 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  27.25 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  31.74 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.78 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  28.72 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.01 
 
 		 399 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.22 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.35 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  28.47 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0384  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.33 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  31.16 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.1 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.6 
 
 		 503 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  28.67 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.98 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  28.47 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.46 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  27.51 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  30.61 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.7 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.16 
 
 		 323 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  28.16 
 
 		 398 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.19 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.95 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.6 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.82 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.1 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.1 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  25.78 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.91 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.42 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  28.16 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.44 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.15 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  29.13 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.96 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.95 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  28.02 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.16 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  28.91 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  28.83 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  29.41 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  29.09 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  27.36 
 
 		 292 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.7 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.36 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.54 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.5 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.88 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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