More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6432 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  65.67 
 
 		 735 aa  952    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 734 aa  1488    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  32.96 
 
 		 736 aa  320  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.27 
 
 		 743 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.37 
 
 		 734 aa  147  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.24 
 
 		 756 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.78 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.93 
 
 		 739 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.52 
 
 		 756 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 730 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.12 
 
 		 872 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.87 
 
 		 753 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.13 
 
 		 750 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  20.81 
 
 		 772 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.04 
 
 		 751 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.4 
 
 		 755 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.2 
 
 		 734 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  26.46 
 
 		 718 aa  107  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 745 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.67 
 
 		 721 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  22.4 
 
 		 753 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.3 
 
 		 779 aa  99  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 804 aa  98.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  21.74 
 
 		 782 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.7 
 
 		 454 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.61 
 
 		 745 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.96 
 
 		 742 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 749 aa  95.9  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.35 
 
 		 772 aa  95.9  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  22.59 
 
 		 778 aa  94.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  19.64 
 
 		 737 aa  93.6  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  27.56 
 
 		 802 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.6 
 
 		 737 aa  90.9  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  22.41 
 
 		 710 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.45 
 
 		 779 aa  90.1  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  23.61 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.16 
 
 		 720 aa  89.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.16 
 
 		 756 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 738 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 748 aa  88.2  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  20.33 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.03 
 
 		 711 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  22.07 
 
 		 758 aa  85.1  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  24.25 
 
 		 724 aa  84  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.58 
 
 		 720 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  26.89 
 
 		 217 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  20.97 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.74 
 
 		 726 aa  82  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  30.46 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  22.73 
 
 		 758 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  31.43 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.44 
 
 		 747 aa  81.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  28.79 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.05 
 
 		 736 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.61 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  28.36 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.62 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.26 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  19.8 
 
 		 731 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.99 
 
 		 624 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 778 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.5 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 759 aa  77  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.02 
 
 		 741 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.73 
 
 		 730 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.52 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  24.46 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  21.53 
 
 		 756 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  28.06 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  30.39 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.36 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  25.6 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 776 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.81 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.83 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 764 aa  74.3  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  29.58 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  31.91 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  30.56 
 
 		 802 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  30.39 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.15 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  25.15 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.26 
 
 		 739 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.74 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.26 
 
 		 739 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  31.08 
 
 		 733 aa  73.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.26 
 
 		 739 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.55 
 
 		 615 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  23.67 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.15 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.15 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 704 aa  73.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.15 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  30.46 
 
 		 745 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  20.13 
 
 		 739 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.31 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>