More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6266 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  48.26 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  42.67 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  45.29 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  31.03 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  28.99 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  27.16 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  28.93 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>