111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3866 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 357 aa  733    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  51.99 
 
 		 354 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  49.56 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  45.07 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  46.9 
 
 		 356 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  41.74 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  41.37 
 
 		 395 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  39.59 
 
 		 366 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  40.77 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  30.85 
 
 		 404 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  33.74 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.64 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  30.29 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  32.32 
 
 		 383 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.23 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  27.99 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  30.57 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  29.19 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  29.04 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  31.99 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  29.09 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  29.09 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  34.42 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  27.97 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  29.24 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  28.37 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  28.08 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.28 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.79 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.38 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  28.9 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  25.5 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  31.14 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  29.49 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.08 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.61 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  25.57 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  23.24 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.42 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.55 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  28.95 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  28.95 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  28.95 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  23.44 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  26.42 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.45 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  28.97 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  29.02 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  23.84 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  20.73 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  25.42 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  25.17 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  23.95 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  26.3 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.17 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  29.46 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  24.57 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  28.89 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  25.25 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33.04 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.31 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  32.77 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  27.71 
 
 		 173 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  26.64 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 111 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  27.01 
 
 		 273 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  26.86 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.07 
 
 		 174 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  28.71 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  23.74 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.39 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  26.8 
 
 		 169 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  25.15 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  28 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.46 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  23.27 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  26.17 
 
 		 175 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  27.37 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  31.96 
 
 		 141 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  29.03 
 
 		 188 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  25.46 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 187 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  35.16 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  26.94 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>