195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2655 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  100 
 
 		 332 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  72.76 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  71.1 
 
 		 301 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  69.44 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  69.44 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  68.79 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  61.3 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  67.11 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  73.75 
 
 		 301 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  52.69 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  55.79 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  42.36 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  44.22 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  40.27 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  35.33 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  35 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  36.59 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  37.02 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  32.78 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  39.04 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  34.55 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  33 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  38.38 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  30.66 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  35.1 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  33.78 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  32.24 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.14 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30.66 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  31.43 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  33.11 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  31.68 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  32.85 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  31.65 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.25 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  34.63 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  34.01 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  34.01 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  29.26 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  35.88 
 
 		 301 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  30.16 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  22.18 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  32.01 
 
 		 310 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  32.43 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  30.49 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  32.13 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  26.33 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.51 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.5 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.65 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.41 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.6 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  30.73 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.09 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.4 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  28.33 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  25.51 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25.4 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  25.27 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.24 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  28.57 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.75 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.56 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.14 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  24.18 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>