More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1121 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1121  ROK  100 
 
 		 330 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  66.15 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  64.54 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  58.73 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0500  glucokinase  58.13 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0516  ROK family protein  58.13 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.57 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.97 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  30.03 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.85 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.12 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.12 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  27.9 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  30 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  30.98 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  28.52 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  27.72 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  27.61 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  30.79 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  31.91 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  31 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  31.2 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.22 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.13 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.78 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  27.94 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.75 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  27.03 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  29.62 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.83 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.04 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  30.74 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  30.74 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  30.74 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  32.53 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  27.84 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.28 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  27.11 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  30 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  27.61 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.02 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.79 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  28.83 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.82 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.1 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  30.79 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.08 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  29.79 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.38 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  26.54 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.94 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.73 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.61 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.23 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1379  N-acetylmannosamine kinase  31.34 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.48 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.81 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  29.07 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  30.03 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.86 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  37.5 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  28.96 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  30.22 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  26.79 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  24.54 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  26.09 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.12 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.55 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  24.63 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  30.88 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.53 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.87 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.69 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.69 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.69 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  26.73 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.69 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  30.62 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.69 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.82 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.22 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  35.22 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  29.74 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  30.63 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  26.55 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  31.19 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  28.7 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  30.71 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2265  ROK  28.04 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.09 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.03 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
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NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.18 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  27.13 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  27.13 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  33.16 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  31.21 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.18 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0049  ROK family protein  27.71 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  23.62 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
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