More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1379 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1379  N-acetylmannosamine kinase  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  43.21 
 
 
290 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  43.21 
 
 
290 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  43.21 
 
 
290 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  43.06 
 
 
292 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  42.25 
 
 
289 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  40.22 
 
 
291 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  40.22 
 
 
291 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  40.22 
 
 
291 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  40.22 
 
 
291 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  40.22 
 
 
291 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  40.22 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  39.86 
 
 
291 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  39.86 
 
 
291 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  39.49 
 
 
291 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3529  N-acetylmannosamine kinase  37.32 
 
 
291 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3696  N-acetylmannosamine kinase  37.32 
 
 
291 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3599  N-acetylmannosamine kinase  37.32 
 
 
291 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3527  N-acetylmannosamine kinase  37.32 
 
 
291 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3634  N-acetylmannosamine kinase  37.32 
 
 
291 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1520  ROK family protein  31.94 
 
 
290 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.969416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.11 
 
 
300 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  36.68 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0354  ROK family protein  34.4 
 
 
525 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0411  ROK family protein  34.4 
 
 
525 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  36.84 
 
 
316 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  33.08 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.35 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.34 
 
 
342 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.53 
 
 
306 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.16 
 
 
321 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.44 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.44 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  31.99 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  30.13 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  28.52 
 
 
314 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  36.7 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  26.74 
 
 
347 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.27 
 
 
320 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  29.62 
 
 
328 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.29 
 
 
299 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.17 
 
 
322 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  35.08 
 
 
315 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  30.74 
 
 
291 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  34.45 
 
 
321 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  27.41 
 
 
315 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  29.62 
 
 
320 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  29.39 
 
 
315 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  33.46 
 
 
302 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  33.46 
 
 
302 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  35.55 
 
 
317 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  32.14 
 
 
314 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.17 
 
 
313 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  28.25 
 
 
332 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  30.29 
 
 
312 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  35.26 
 
 
255 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.33 
 
 
335 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  32.96 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  33.07 
 
 
302 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  33.56 
 
 
298 aa  99  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  32.95 
 
 
315 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.8 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.92 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.18 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  33.46 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  30.66 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.45 
 
 
391 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  27.18 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  31.3 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  35.11 
 
 
363 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  27.84 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  29.74 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.57 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1421  ROK family protein  31.65 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  26.69 
 
 
384 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  34.58 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  30.36 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.06 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.47 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  31.06 
 
 
296 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.65 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.21 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  29.97 
 
 
314 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  32.08 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  25.17 
 
 
429 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  31.3 
 
 
400 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.27 
 
 
306 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.21 
 
 
317 aa  92.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.72 
 
 
321 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  36.32 
 
 
363 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  29.74 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.09 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  31.27 
 
 
361 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.36 
 
 
389 aa  92.4  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.33 
 
 
302 aa  92  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  29.61 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  32.13 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  30.35 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  26.64 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  30.53 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>