More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6372 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  61.18 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 412 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  29.01 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  28.65 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.54 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  29.78 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.55 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  24.4 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.55 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.55 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.34 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.55 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  27.79 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.55 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.55 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.55 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.28 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.17 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.17 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.84 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.1 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  29.03 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 436 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  23.88 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  24.74 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.17 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.44 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.35 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  22.78 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.62 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  24.17 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  23.89 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  23.61 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>