More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5509 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  40.87 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  39.78 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 128 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  28.19 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  36.63 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  39.77 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  34.44 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.78 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  37.84 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 135 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  30.65 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  30.65 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  35.96 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  35.19 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  38.55 
 
 		 129 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  34.21 
 
 		 126 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7817  Endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  29.41 
 
 		 126 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 126 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 126 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 		 510 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.23 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 119 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 126 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  34.88 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 128 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 134 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.95 
 
 		 131 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  29.63 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  35.4 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.25 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  27.56 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 131 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 131 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 133 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 136 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  29.31 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 127 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  34.48 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>