More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0463 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  89.98 
 
 		 479 aa  875    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  71.18 
 
 		 471 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  100 
 
 		 479 aa  953    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  89.14 
 
 		 479 aa  844    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  82.28 
 
 		 478 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  82.28 
 
 		 478 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  58.95 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  58.16 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  57.68 
 
 		 486 aa  541  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  57.42 
 
 		 483 aa  510  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  57.11 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  55.06 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  55.41 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  54.91 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  46.8 
 
 		 495 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  43.88 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  39.32 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  37.72 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  33.63 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.43 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.95 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.16 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.37 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.79 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 		 452 aa  107  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.57 
 
 		 486 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  24.24 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.55 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.21 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  27.92 
 
 		 507 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.27 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.87 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 484 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 500 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.24 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 490 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 459 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.57 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.34 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.81 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  25.79 
 
 		 741 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.65 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.5 
 
 		 482 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.89 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 527 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  28.14 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.81 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.63 
 
 		 508 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  26.35 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  26.35 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.08 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  27.42 
 
 		 476 aa  86.7  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1121 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.29 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  26.43 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.95 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.79 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  23.9 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.79 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.65 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.68 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.68 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.2 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.68 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.65 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.68 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.68 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.21 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.45 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.4 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.56 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.85 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.48 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.11 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  26.27 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  24.36 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  25.66 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.6 
 
 		 596 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  24.48 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.68 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  24.48 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>