More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3042 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1217    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  38.84 
 
 		 596 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.38 
 
 		 593 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  38.41 
 
 		 606 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.78 
 
 		 593 aa  349  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.32 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.04 
 
 		 592 aa  333  6e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.02 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.09 
 
 		 584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.45 
 
 		 593 aa  319  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.12 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  35.08 
 
 		 1138 aa  309  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  33.5 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.69 
 
 		 598 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  28.98 
 
 		 587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  28.98 
 
 		 587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.99 
 
 		 580 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.56 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  34.82 
 
 		 595 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.04 
 
 		 618 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.13 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  31.58 
 
 		 602 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 599 aa  297  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.41 
 
 		 619 aa  296  6e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.69 
 
 		 1228 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.96 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.98 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.34 
 
 		 1091 aa  289  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  33.84 
 
 		 609 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.85 
 
 		 677 aa  286  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  31.29 
 
 		 573 aa  286  9e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  31.29 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 		 581 aa  280  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.28 
 
 		 565 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  34.21 
 
 		 611 aa  276  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.07 
 
 		 589 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  31.38 
 
 		 609 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 578 aa  271  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  34.15 
 
 		 603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  30.82 
 
 		 1194 aa  271  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  31.38 
 
 		 596 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  31.18 
 
 		 608 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.35 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.21 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  29.06 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.67 
 
 		 600 aa  266  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  31.89 
 
 		 603 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.91 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  31.42 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.39 
 
 		 608 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  31.96 
 
 		 581 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.17 
 
 		 592 aa  260  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  30.6 
 
 		 576 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.29 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  37.14 
 
 		 585 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  33.75 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.93 
 
 		 599 aa  257  5e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.09 
 
 		 581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  32.31 
 
 		 624 aa  253  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  31.46 
 
 		 600 aa  253  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.94 
 
 		 583 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.14 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  33.15 
 
 		 575 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 579 aa  250  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.76 
 
 		 583 aa  250  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 		 581 aa  249  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.48 
 
 		 577 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  35.2 
 
 		 593 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.06 
 
 		 600 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  33.65 
 
 		 595 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  33.74 
 
 		 598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.43 
 
 		 574 aa  244  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  26.94 
 
 		 577 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  26.94 
 
 		 577 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  31.5 
 
 		 584 aa  243  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  31.49 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.45 
 
 		 578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.57 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  30.92 
 
 		 597 aa  240  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.83 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.21 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  32.55 
 
 		 606 aa  237  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.2 
 
 		 571 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.23 
 
 		 588 aa  237  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.2 
 
 		 571 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  31.5 
 
 		 606 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 578 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32 
 
 		 571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>