119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1912 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  563  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  49.65 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  48.26 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  50.18 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  50.55 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  45.13 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  47.12 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  39.07 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  41.64 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  39.43 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  41.01 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  39.3 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  37.76 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  32.05 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  38.52 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  35.93 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  39.05 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  36.3 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  33.69 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  34.86 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.73 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.61 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.56 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.9 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.15 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.95 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.62 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.97 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.49 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.87 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.83 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.15 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.98 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  31.8 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.29 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.76 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.39 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.63 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.68 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.62 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.74 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.3 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.23 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  30.21 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.07 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.17 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  25.21 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  29.54 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  27.95 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.21 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.07 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.13 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  24.36 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  30.4 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  21.92 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  30.22 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.61 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.18 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  31.11 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.79 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  29.35 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  28.83 
 
 		 339 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.08 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  27.59 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.27 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  30.07 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  30.48 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.98 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  29.06 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  27.8 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  23.17 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  29.02 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  36.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  31.84 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  28.86 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  22.03 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  29.22 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.97 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  28.83 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>