More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2031 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  100 
 
 
356 aa  732    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  76.27 
 
 
356 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  75.71 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  76.55 
 
 
356 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  76.84 
 
 
357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  75.42 
 
 
356 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  54.07 
 
 
361 aa  355  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  47.89 
 
 
370 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  47.89 
 
 
370 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  47.89 
 
 
370 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  47.04 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  46.75 
 
 
437 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  45.86 
 
 
427 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  45.56 
 
 
427 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  46.38 
 
 
383 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  45.56 
 
 
427 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  46.71 
 
 
358 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  46.22 
 
 
387 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  45.64 
 
 
383 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.74 
 
 
349 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  45.35 
 
 
383 aa  292  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  45.64 
 
 
387 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  47.16 
 
 
358 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  44.76 
 
 
351 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  45.64 
 
 
386 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  46.02 
 
 
350 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.48 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  45.74 
 
 
350 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  45.04 
 
 
351 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  45.35 
 
 
388 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  45.43 
 
 
360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  45.59 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  46.85 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  43.43 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  46.55 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.5 
 
 
370 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.61 
 
 
360 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  44.61 
 
 
372 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  43.31 
 
 
366 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  43.31 
 
 
366 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  43.55 
 
 
372 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  43.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  43.02 
 
 
366 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  42.23 
 
 
344 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  44.18 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  43.31 
 
 
388 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  44.38 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  42.65 
 
 
347 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  44.64 
 
 
360 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  41.95 
 
 
350 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  43.38 
 
 
360 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  46.23 
 
 
339 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  43.84 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  43.24 
 
 
347 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  41.74 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  42.94 
 
 
347 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  43.95 
 
 
374 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  44 
 
 
366 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  43.02 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  43.82 
 
 
345 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  44.57 
 
 
369 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  42.26 
 
 
356 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  41.47 
 
 
347 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  42.12 
 
 
347 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  43.75 
 
 
348 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  45.78 
 
 
351 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  42.94 
 
 
361 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  42.36 
 
 
347 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  41.18 
 
 
347 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  42.36 
 
 
347 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  46.93 
 
 
432 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  46.06 
 
 
352 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  42.34 
 
 
365 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  42.65 
 
 
347 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  41.62 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  42.32 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  42.65 
 
 
347 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  41.76 
 
 
347 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  42.94 
 
 
345 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  43.24 
 
 
345 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  43.45 
 
 
402 aa  261  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  42.86 
 
 
357 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  42.81 
 
 
375 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  43.28 
 
 
358 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  41.21 
 
 
347 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  45.34 
 
 
362 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  42.51 
 
 
360 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  42.36 
 
 
347 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  43.92 
 
 
360 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  42.77 
 
 
362 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  41.09 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  41.76 
 
 
347 aa  258  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  41.49 
 
 
366 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  41.23 
 
 
347 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  41.47 
 
 
347 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  41.46 
 
 
372 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  41.49 
 
 
366 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  40.92 
 
 
347 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  44.58 
 
 
403 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  43.5 
 
 
356 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>