More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0818 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 767 aa  1560    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0870  putative secretion pathway protein  28 
 
 		 606 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  30.13 
 
 		 686 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  28.14 
 
 		 805 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  32.52 
 
 		 783 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  27.62 
 
 		 716 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  30.16 
 
 		 763 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  27.27 
 
 		 609 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  31.18 
 
 		 803 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.43 
 
 		 550 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 		 682 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  31.1 
 
 		 717 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  30.48 
 
 		 807 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.03 
 
 		 689 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  31.31 
 
 		 744 aa  95.5  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  29.22 
 
 		 681 aa  95.5  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  28.25 
 
 		 776 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.73 
 
 		 558 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.44 
 
 		 635 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  32.8 
 
 		 702 aa  93.6  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  28.17 
 
 		 569 aa  94  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  28.81 
 
 		 804 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.47 
 
 		 559 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.47 
 
 		 559 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  29.37 
 
 		 714 aa  92.4  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  24.8 
 
 		 745 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.15 
 
 		 662 aa  92  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  25.9 
 
 		 634 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  28.06 
 
 		 640 aa  91.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 640 aa  91.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 640 aa  91.3  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 640 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  25.77 
 
 		 710 aa  91.3  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  25.52 
 
 		 554 aa  90.9  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.47 
 
 		 559 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.47 
 
 		 559 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  27.38 
 
 		 640 aa  90.9  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  30.7 
 
 		 787 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  30.14 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 750 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.11 
 
 		 787 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 797 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  27.41 
 
 		 686 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  28.85 
 
 		 655 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  31.28 
 
 		 814 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.25 
 
 		 753 aa  90.5  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.74 
 
 		 561 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.44 
 
 		 567 aa  89.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 		 660 aa  90.1  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  27.43 
 
 		 649 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  24.92 
 
 		 537 aa  89.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  25.23 
 
 		 781 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  25 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.09 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  23.68 
 
 		 799 aa  89.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  26.61 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  26.61 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  28.72 
 
 		 546 aa  90.1  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  26.42 
 
 		 630 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  25.46 
 
 		 703 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  25.15 
 
 		 543 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  27.71 
 
 		 750 aa  89  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  27.37 
 
 		 560 aa  88.6  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.44 
 
 		 696 aa  88.6  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  31.28 
 
 		 791 aa  88.6  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.78 
 
 		 562 aa  88.2  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 780 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  29.77 
 
 		 774 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  29.77 
 
 		 774 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  26.85 
 
 		 654 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  27.3 
 
 		 636 aa  87.8  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  26.85 
 
 		 654 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  27.11 
 
 		 686 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  26.85 
 
 		 650 aa  87.8  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  27.11 
 
 		 686 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 686 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 686 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.52 
 
 		 563 aa  87.4  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  25.95 
 
 		 710 aa  87.4  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 775 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  27.39 
 
 		 630 aa  87  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  25.71 
 
 		 681 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  25.15 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  25.68 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.13 
 
 		 704 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  23.01 
 
 		 904 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  26.78 
 
 		 728 aa  86.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.13 
 
 		 704 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  26.4 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  25.84 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 771 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  24.92 
 
 		 740 aa  85.9  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 777 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  30.81 
 
 		 675 aa  85.5  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  24.6 
 
 		 767 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>