More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2668 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 863 aa  714    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 876 aa  726    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 876 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 875 aa  733    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 875 aa  730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 874 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 876 aa  760    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 885 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 867 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 878 aa  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 884 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 874 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 885 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 874 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 874 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 874 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 892 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 874 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 860 aa  683    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 860 aa  689    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 899 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 871 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 874 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 886 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 891 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 875 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  44.44 
 
 		 873 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 874 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 874 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 882 aa  736    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 897 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  71.17 
 
 		 887 aa  1263    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  77.43 
 
 		 886 aa  1420    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 876 aa  734    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 880 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 864 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 874 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 860 aa  731    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 872 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 862 aa  695    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 876 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 881 aa  728    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 874 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 905 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 879 aa  733    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 896 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 881 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 892 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 876 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 875 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 931 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 874 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 878 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 874 aa  717    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 891 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 868 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 897 aa  635    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 890 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 884 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 903 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 887 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 872 aa  724    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 897 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 865 aa  727    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 875 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 877 aa  798    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 863 aa  657    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 897 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 874 aa  695    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 874 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 874 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 869 aa  704    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 874 aa  712    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 880 aa  679    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 874 aa  721    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 874 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 874 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 880 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 897 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 885 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 878 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 874 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 904 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 878 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  73.53 
 
 		 888 aa  1335    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 885 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 900 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 867 aa  670    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 876 aa  693    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 879 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 874 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 874 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>