More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1894 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 904 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 876 aa  688    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 876 aa  688    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 874 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 882 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 875 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 876 aa  958    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 879 aa  1815    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 879 aa  898    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 897 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 885 aa  755    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 874 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 876 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 876 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 876 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 874 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 903 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 875 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 874 aa  670    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 876 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 860 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 860 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 874 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 899 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 892 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 876 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 874 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 876 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 875 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 860 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  43.49 
 
 		 873 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 874 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 875 aa  688    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 882 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 897 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 887 aa  693    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 886 aa  724    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 876 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 882 aa  656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 864 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 874 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 872 aa  648    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 865 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 862 aa  651    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 874 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 888 aa  761    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 863 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 876 aa  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 874 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 888 aa  747    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 875 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 875 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 876 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 875 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 892 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 868 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 892 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 884 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 937 aa  650    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 874 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 897 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 865 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 931 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 877 aa  1045    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 876 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 874 aa  693    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 897 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 874 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 874 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 869 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 874 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 905 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 874 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 872 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 897 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 897 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 886 aa  759    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 874 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 845 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 878 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 888 aa  755    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 900 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>