More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1952 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
876 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
876 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
874 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
876 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
875 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
874 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
876 aa  754    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
876 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
867 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
892 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
884 aa  710    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
875 aa  727    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
876 aa  667    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
876 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
903 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
874 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
874 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
874 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
879 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
878 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
874 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
860 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
860 aa  695    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
899 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
890 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
871 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
880 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
874 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
886 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
891 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
874 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  45.24 
 
 
873 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
874 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
883 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
882 aa  705    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
897 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
887 aa  1819    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
874 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  70.29 
 
 
886 aa  1271    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
876 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
880 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
864 aa  710    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
883 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
875 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
874 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
860 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
862 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
874 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
881 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
874 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
863 aa  638    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
874 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
931 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
883 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
876 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
875 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
892 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
874 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
878 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
874 aa  700    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
874 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
897 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
868 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
887 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
890 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
884 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
876 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
902 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
874 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
897 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
872 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
865 aa  728    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
874 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
877 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
879 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
879 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
874 aa  702    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
874 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
874 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
874 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
869 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
874 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
880 aa  661    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
874 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
874 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
874 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
863 aa  697    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
897 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
885 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
878 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
874 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
872 aa  705    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
878 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  70.01 
 
 
888 aa  1261    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
885 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
900 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
867 aa  683    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
876 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
879 aa  701    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
874 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>