269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1170 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  100 
 
 		 1271 aa  2589    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  28.08 
 
 		 1259 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  29.2 
 
 		 1267 aa  326  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  27.57 
 
 		 1297 aa  317  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1297 aa  317  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  27.26 
 
 		 1297 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  28.12 
 
 		 1315 aa  299  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  28.27 
 
 		 1315 aa  295  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  27.79 
 
 		 1265 aa  277  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  27.59 
 
 		 1160 aa  253  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  35.73 
 
 		 1157 aa  239  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  35.26 
 
 		 1157 aa  221  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  35.26 
 
 		 1157 aa  221  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  35.26 
 
 		 1157 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  35.26 
 
 		 1157 aa  220  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1157 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  35.26 
 
 		 1157 aa  220  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  35.26 
 
 		 1140 aa  221  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  35.17 
 
 		 1150 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  35.34 
 
 		 1150 aa  220  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  35.17 
 
 		 1172 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  35.54 
 
 		 1180 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  35.54 
 
 		 1180 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  35.81 
 
 		 1159 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  27.69 
 
 		 1313 aa  212  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  33.89 
 
 		 1164 aa  202  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  33.87 
 
 		 1230 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  33.6 
 
 		 1172 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  34.54 
 
 		 1569 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  32.75 
 
 		 1244 aa  184  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1172 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  35.91 
 
 		 289 aa  181  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  32.99 
 
 		 1542 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  33.33 
 
 		 1588 aa  180  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  31.36 
 
 		 1186 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  34.15 
 
 		 1266 aa  164  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  34.15 
 
 		 1574 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  34.15 
 
 		 1574 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  34.15 
 
 		 1580 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  34.06 
 
 		 1548 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 1544 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  34.51 
 
 		 1471 aa  157  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  33.01 
 
 		 1331 aa  153  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  31.82 
 
 		 1367 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  32 
 
 		 1324 aa  140  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  30.09 
 
 		 1309 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 878 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 		 810 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1676 aa  74.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.46 
 
 		 681 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 2240 aa  66.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  23.61 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.92 
 
 		 837 aa  64.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 1737 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.68 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 927 aa  60.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 3145 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  21.79 
 
 		 1213 aa  58.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.25 
 
 		 622 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.07 
 
 		 594 aa  58.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 515 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 486 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 637 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 572 aa  57.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 662 aa  57.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1154 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.79 
 
 		 725 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.68 
 
 		 603 aa  56.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 620 aa  57  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 377 aa  56.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.18 
 
 		 887 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 739 aa  56.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.61 
 
 		 875 aa  55.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 792 aa  55.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.77 
 
 		 566 aa  55.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.38 
 
 		 1979 aa  55.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 649 aa  55.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 583 aa  54.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 4079 aa  54.3  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 265 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 370 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 670 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 847 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  20.99 
 
 		 379 aa  54.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 573 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 287 aa  53.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.01 
 
 		 816 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3611  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.33 
 
 		 263 aa  54.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 250 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.48 
 
 		 695 aa  53.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 573 aa  53.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.09 
 
 		 620 aa  53.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 641 aa  53.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>