More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0642 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 644 aa  1228    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.939585  hitchhiker  0.000667074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.05 
 
 		 677 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.81 
 
 		 644 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.724579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4936  methyl-accepting chemotaxis protein  59.78 
 
 		 644 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.74 
 
 		 644 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0578  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  60.34 
 
 		 644 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0529  chemotaxis sensory transducer  60.89 
 
 		 673 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.12 
 
 		 644 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  39.56 
 
 		 559 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 665 aa  173  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 		 545 aa  171  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.62 
 
 		 714 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 714 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 637 aa  170  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.69 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  35.98 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 		 560 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.24 
 
 		 634 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  38.43 
 
 		 578 aa  167  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 666 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  30.37 
 
 		 546 aa  165  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  28.6 
 
 		 634 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 		 627 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 560 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.52 
 
 		 624 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 714 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 624 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  37.14 
 
 		 578 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  36.32 
 
 		 549 aa  161  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 714 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 		 564 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.7 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.18 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 		 543 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 667 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.93 
 
 		 624 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  38.24 
 
 		 561 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  33.1 
 
 		 497 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 667 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 667 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  38.24 
 
 		 561 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  32.98 
 
 		 553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2733  methyl-accepting chemotaxis protein  33.73 
 
 		 485 aa  157  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.501844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 		 633 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  38.16 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 633 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 		 667 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 667 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 654 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 633 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 715 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  41 
 
 		 706 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  39.51 
 
 		 545 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  37.01 
 
 		 545 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 558 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 405 aa  154  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 568 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 		 543 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  35 
 
 		 553 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 629 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.33 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 668 aa  153  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 		 633 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 667 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.18 
 
 		 630 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.81 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 667 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 561 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 540 aa  151  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 624 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 702 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 667 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 541 aa  150  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 569 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  39.85 
 
 		 639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.52 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  34.47 
 
 		 629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.81 
 
 		 650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>