More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2733 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2733  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 485 aa  956    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.501844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 		 497 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 716 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 713 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  36.1 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  33.18 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.41 
 
 		 712 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.41 
 
 		 712 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 541 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 714 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 715 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 637 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 636 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  34.62 
 
 		 557 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 		 714 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 714 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.81 
 
 		 714 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.54 
 
 		 643 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 		 568 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.73 
 
 		 559 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.54 
 
 		 626 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 628 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  37.4 
 
 		 643 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 688 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 		 714 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.54 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  35.82 
 
 		 545 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 552 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.44 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 688 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.53 
 
 		 688 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  34.54 
 
 		 714 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  34.78 
 
 		 714 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 627 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 688 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 		 634 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 541 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 		 637 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 674 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  36.14 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  34.25 
 
 		 546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 		 712 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  40.3 
 
 		 628 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 624 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 543 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 560 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 543 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 543 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  36.39 
 
 		 626 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 671 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 		 553 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  37.28 
 
 		 639 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 640 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 626 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  33.9 
 
 		 632 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  35.81 
 
 		 629 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 		 738 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  35.81 
 
 		 629 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 		 634 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  33.66 
 
 		 632 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 630 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 642 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 		 645 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  37.43 
 
 		 706 aa  192  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 702 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 630 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.8 
 
 		 630 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  41.53 
 
 		 628 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 638 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  37.92 
 
 		 697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  36.94 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 645 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  36.34 
 
 		 642 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 543 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.62 
 
 		 495 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 543 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  35.65 
 
 		 545 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  38.57 
 
 		 561 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.86 
 
 		 539 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 645 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  37 
 
 		 545 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 625 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 645 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>