More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2459 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  100 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  58.6 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  60.36 
 
 		 300 aa  332  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  57.89 
 
 		 318 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  57.19 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  56.49 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  58.36 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  57.93 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  57.35 
 
 		 299 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  53.51 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  50.34 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  49.32 
 
 		 328 aa  291  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  53.85 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  52.99 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  48.98 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  47.96 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  47.96 
 
 		 313 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  50 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  43.94 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  44.8 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  46.82 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  47.74 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  47.95 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  43.21 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  43.68 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  48.03 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  46.67 
 
 		 340 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  46.67 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  43.06 
 
 		 293 aa  241  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  45.98 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  44.48 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  41.3 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  43.57 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  45.96 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  42.91 
 
 		 290 aa  236  5.0000000000000005e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  46.01 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  45.31 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  45.13 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  43.84 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  43.48 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  43.3 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  43.27 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  40.86 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  43.01 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  42.64 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  43.62 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  41.48 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  40.35 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.93 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  42.02 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  43.55 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  45.25 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  39.52 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  43.64 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  39.39 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  39.26 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  39.26 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  41.58 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  37.94 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  42.31 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  42.91 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  40.07 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  41.01 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  39.53 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  43.73 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  41.43 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  40.55 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  39.19 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  39.93 
 
 		 292 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  40 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  38.38 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  40 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  41.76 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  35.9 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  38.97 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.46 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.68 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  38.13 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  38.83 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  41.24 
 
 		 300 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  40.21 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  36.99 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  37.76 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  41.44 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  38.14 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  39.18 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  39.18 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  39.85 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  37.67 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  42.61 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  39.72 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  42.61 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  42.15 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  37.72 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  38.73 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  43.21 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  37.33 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  42.21 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  42.25 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  39.5 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>