More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3676 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 524 aa  1056    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  42.88 
 
 		 593 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  37.88 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  41.61 
 
 		 600 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 563 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  38.63 
 
 		 566 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  35.76 
 
 		 570 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  38.97 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 563 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 563 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  36.88 
 
 		 549 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 579 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  39.4 
 
 		 520 aa  286  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 545 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  38.94 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 538 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 557 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 545 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 545 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 581 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  43.66 
 
 		 230 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 548 aa  172  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 274 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 361 aa  90.1  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 636 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 356 aa  88.6  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 302 aa  87  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 341 aa  86.7  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 297 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 636 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  28.43 
 
 		 1110 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.46 
 
 		 1144 aa  83.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  23.62 
 
 		 550 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 867 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 287 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 860 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.23 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 859 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  30.49 
 
 		 1118 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  27.01 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  30.49 
 
 		 1120 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  28 
 
 		 1111 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  27.01 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  27.01 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.27 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  27.18 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  27.18 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  27.18 
 
 		 1120 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.55 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>