168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3570 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  33.85 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.43 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.02 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.02 
 
 		 307 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  30.33 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.08 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.08 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  31.02 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  32.3 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.08 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.47 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.35 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  33.18 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.43 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.43 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.62 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.71 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.43 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.86 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  31.52 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.38 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.4 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.4 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.12 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.78 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.81 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.12 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  27.62 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.1 
 
 		 581 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  33.14 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  24.74 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  30.77 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.9 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.18 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  29.72 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.19 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.45 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.47 
 
 		 579 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  29.36 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.44 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.41 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.41 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.09 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  25.99 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.53 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  30.5 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.27 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.09 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  29.27 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  29.27 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  29.27 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.04 
 
 		 1293 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  25.69 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  25.38 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.47 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  25.74 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  26.87 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  25.74 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  32.95 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  26.86 
 
 		 545 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  32.5 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.31 
 
 		 930 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  23.56 
 
 		 676 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.5 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  26.86 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  29.07 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  29.9 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  24.37 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  25.39 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.67 
 
 		 831 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  26.29 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7307  gluconolactonase  24.35 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  25.95 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  22.35 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.22 
 
 		 533 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.74 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  29.23 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.2 
 
 		 668 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  23.83 
 
 		 627 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  29.22 
 
 		 354 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  26.42 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  25.45 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.07 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  22.87 
 
 		 338 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  25.91 
 
 		 327 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.32 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  26.67 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  26.37 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  36.71 
 
 		 353 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.62 
 
 		 588 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.85 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  23.63 
 
 		 522 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.45 
 
 		 390 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  26.29 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  28.11 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  25 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>