More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2329 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  63.8 
 
 		 763 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  67.94 
 
 		 678 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  72.37 
 
 		 680 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  64.38 
 
 		 693 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  65.57 
 
 		 694 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  71.77 
 
 		 680 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 968 aa  1997    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  68.3 
 
 		 684 aa  717    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  67.54 
 
 		 741 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  66.67 
 
 		 702 aa  742    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  65.28 
 
 		 808 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  65.67 
 
 		 688 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  68.54 
 
 		 680 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  62.5 
 
 		 790 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  68.94 
 
 		 680 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  56.62 
 
 		 680 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  57.34 
 
 		 671 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  38.62 
 
 		 975 aa  589  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  53.66 
 
 		 675 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  54.64 
 
 		 689 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  54.17 
 
 		 675 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  53.08 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  37.52 
 
 		 1019 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  38.82 
 
 		 901 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  37.91 
 
 		 886 aa  502  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  37.03 
 
 		 842 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  36.77 
 
 		 1019 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  46.64 
 
 		 1118 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  35.54 
 
 		 910 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  34.89 
 
 		 845 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  33.7 
 
 		 845 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  34.6 
 
 		 843 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  35.17 
 
 		 834 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 		 834 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 		 834 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 		 871 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  34.15 
 
 		 865 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.54 
 
 		 875 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.82 
 
 		 855 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  30.19 
 
 		 1057 aa  386  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  30 
 
 		 1059 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  29.74 
 
 		 1063 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  29.86 
 
 		 1063 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  30.22 
 
 		 1057 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  32.96 
 
 		 822 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  29.86 
 
 		 1063 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  30.52 
 
 		 1074 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.25 
 
 		 890 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  32.86 
 
 		 907 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 		 841 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  32.68 
 
 		 826 aa  364  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  37.33 
 
 		 692 aa  363  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  33.42 
 
 		 885 aa  362  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  32.52 
 
 		 838 aa  362  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  36.38 
 
 		 692 aa  357  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.4 
 
 		 853 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  30.36 
 
 		 1048 aa  347  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  30.94 
 
 		 837 aa  346  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  30.41 
 
 		 885 aa  344  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  29.68 
 
 		 920 aa  344  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  33.43 
 
 		 1284 aa  343  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  32.7 
 
 		 846 aa  343  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  37.43 
 
 		 682 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  37.25 
 
 		 754 aa  342  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  36.63 
 
 		 754 aa  339  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  37.23 
 
 		 741 aa  339  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  37.4 
 
 		 741 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  30.21 
 
 		 941 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  30.8 
 
 		 912 aa  337  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  37.38 
 
 		 1017 aa  336  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.61 
 
 		 958 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  37.58 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  35.94 
 
 		 771 aa  335  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  38.12 
 
 		 609 aa  335  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  38.03 
 
 		 616 aa  333  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  37.84 
 
 		 615 aa  333  8e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  31.84 
 
 		 1284 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  31.64 
 
 		 918 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  37.58 
 
 		 740 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  30.37 
 
 		 840 aa  332  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  37.58 
 
 		 740 aa  332  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  37.4 
 
 		 678 aa  332  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  37.38 
 
 		 617 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  36.01 
 
 		 1095 aa  329  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  36.98 
 
 		 618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  39.23 
 
 		 723 aa  328  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  39.02 
 
 		 706 aa  327  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  37.05 
 
 		 617 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  35.81 
 
 		 694 aa  327  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  31.16 
 
 		 862 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  31.07 
 
 		 889 aa  326  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 		 923 aa  325  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  37.05 
 
 		 617 aa  325  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  37.63 
 
 		 656 aa  324  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  29.86 
 
 		 851 aa  325  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  37.45 
 
 		 610 aa  324  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  39.43 
 
 		 706 aa  324  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>