More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0831 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  65.6 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  59.17 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  57.27 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  49.74 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.37 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.38 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.2 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  44.56 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  51.63 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.52 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.15 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  42.36 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  44.78 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  44.56 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  34.98 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  38.53 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  36.7 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  43.17 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 196 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  34.86 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  38.6 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  34.86 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>