More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0616 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  100 
 
 		 394 aa  829    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  63.66 
 
 		 390 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  27.51 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 419 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  26.11 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  26.7 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  24.23 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  25.61 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  23.31 
 
 		 367 aa  88.2  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  25.07 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  22.47 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  22.47 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  25.1 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0234  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92147e-39 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  24.42 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.21 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  24.92 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  22.71 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  22.71 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  22.56 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.44 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  22.14 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  23.77 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  23.95 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  22.37 
 
 		 317 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  29.3 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.42 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  24.07 
 
 		 373 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.68 
 
 		 299 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.39 
 
 		 290 aa  53.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  24.23 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0044  integrase family protein  30.46 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.381266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  24.4 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0860  phage integrase family protein  36.52 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.19 
 
 		 296 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.89 
 
 		 305 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.64 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 294 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 297 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  24.03 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  24.18 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  52.38 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  27.41 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.82 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  23.91 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.16 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  22.89 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  24.83 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  52.38 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  28.57 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.92 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  26.54 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  33.33 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  21.92 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.51 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.74 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.84 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  52.38 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  46 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  21.62 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  52.38 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  52.38 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  50 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  41.18 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  30.4 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  21.13 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>