More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_B0234 on replicon NC_011777
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  88.47 
 
 
347 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0234  phage integrase family protein  100 
 
 
347 aa  713    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92147e-39 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  88.47 
 
 
347 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  85.49 
 
 
317 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0057  integrase-recombinase  30.12 
 
 
381 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0945594  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0056  integrase-recombinase  30.46 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0611528  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5606  integrase family protein  30.18 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5368  integrase family protein  27.81 
 
 
386 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  25.26 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.57 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.33 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  28.1 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  26.37 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.52 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  25.75 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.52 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  23.53 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.63 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  23.7 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  24.11 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24.73 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  26.9 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  30.29 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  22.95 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.47 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.82 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.91 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  26.18 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.91 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  23.47 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  30.18 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.55 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  26.55 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.62 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.64 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  27.21 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  25.94 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  23.27 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.54 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  27.36 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.96 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  24.26 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  23.62 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  24.29 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  26.45 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.51 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.91 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.54 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  25.39 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  31.54 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  30.52 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  26.12 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  23.3 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  23.84 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  25.09 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.72 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.74 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.82 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  29.73 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.27 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  27.47 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.54 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  24.16 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.65 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.03 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.72 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.61 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>