More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5606 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0056  integrase-recombinase  92.29 
 
 		 390 aa  753    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0611528  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5606  integrase family protein  100 
 
 		 390 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0057  integrase-recombinase  53.08 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0945594  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5368  integrase family protein  31.03 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196734  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0234  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92147e-39 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  29.25 
 
 		 317 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  28.99 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  28.99 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  35.06 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  25.28 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  33.75 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  26.43 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  33.12 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.5 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  31.58 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.8 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.94 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.85 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  23.55 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  26.83 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.82 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  32.42 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  25.22 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  26.64 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.23 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.74 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  32.24 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.99 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.95 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  31.2 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.31 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.95 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  24.89 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.89 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.45 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  31.25 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.77 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  27.82 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.45 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  29.39 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.85 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.91 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 296 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.9 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  28.16 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.44 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.59 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  24.71 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.2 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  31.21 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.01 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  32.92 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.01 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  28.25 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  25.5 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  29.15 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  30.34 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  30.61 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  26.46 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  26.29 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  28.25 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.2 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>