More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4020 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  86.19 
 
 		 280 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  42.59 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  43.35 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  41.31 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.46 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  41.96 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  40.72 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  36.77 
 
 		 342 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  37.84 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  38.29 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  36.51 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  36.82 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  41.38 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  35.78 
 
 		 333 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  34.98 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  35.91 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  36.04 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  34.68 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  39.56 
 
 		 327 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  39.19 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  37.02 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  33.78 
 
 		 335 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  37.74 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 		 375 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  38.7 
 
 		 344 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  40.18 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  39.29 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  35.11 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  37.81 
 
 		 336 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  35.96 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  34.48 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  35.59 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  36.24 
 
 		 345 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  33.98 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  34.8 
 
 		 444 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  37.22 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  36.41 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  36.36 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.04 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  34.36 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.77 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.92 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  34.78 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  37.14 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  31.73 
 
 		 320 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  30.8 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  31.67 
 
 		 396 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  32.95 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.5 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.51 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  36.49 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  35.15 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  34.43 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  37.1 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  30.43 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  34.86 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  32.55 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  35.86 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.08 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  36.47 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  34.85 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  38.27 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  34.06 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  33.78 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  34.33 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.47 
 
 		 374 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  36.21 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  36.21 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.15 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  34.47 
 
 		 374 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  30.12 
 
 		 350 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 326 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  28.17 
 
 		 359 aa  99.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  36 
 
 		 374 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  37.6 
 
 		 440 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  40 
 
 		 331 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  32.84 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  37.43 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.75 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  35.08 
 
 		 329 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  34.31 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  26.95 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 327 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.62 
 
 		 368 aa  95.9  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  37.68 
 
 		 327 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.04 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  37.66 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  34.47 
 
 		 347 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  34.51 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  35.2 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  35.03 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  27.66 
 
 		 348 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  37.08 
 
 		 338 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>