229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2732 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  96.77 
 
 		 310 aa  590  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  75.81 
 
 		 311 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  74.52 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  74.84 
 
 		 311 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  71.7 
 
 		 308 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  71.15 
 
 		 304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  70.1 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  70.19 
 
 		 304 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  69.87 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  70.83 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  69.9 
 
 		 301 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  56.03 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  55.92 
 
 		 313 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  53.75 
 
 		 305 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  61.62 
 
 		 302 aa  334  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  55.48 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  60.89 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  55.94 
 
 		 300 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  56.04 
 
 		 300 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  57.45 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  58.42 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  56.55 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  56.55 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  58.42 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  58.42 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  56.55 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  56.55 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  56.21 
 
 		 304 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  56.21 
 
 		 304 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  57.35 
 
 		 300 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  56.21 
 
 		 300 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  57.35 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  58.11 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  53.24 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  50.49 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  52.16 
 
 		 305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  50.81 
 
 		 310 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  49.84 
 
 		 311 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  52.54 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  59.57 
 
 		 307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  50.17 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  55.94 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  53.44 
 
 		 311 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.97 
 
 		 304 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  51.01 
 
 		 316 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  51.01 
 
 		 316 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.06 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  50.84 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.35 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.87 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  51.01 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  49.03 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  50 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.14 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  48.99 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  36.11 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  33.9 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.42 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.05 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.43 
 
 		 275 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  32.78 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.24 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.42 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  36.76 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.42 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  34.63 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.03 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.14 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.77 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  32.97 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.16 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  29.93 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.7 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  33.72 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.95 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  32.53 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.94 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  34.53 
 
 		 276 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.32 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  38.3 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.5 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  32.54 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  34.2 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.55 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.78 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.64 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  32.82 
 
 		 278 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  32.2 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.67 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  31.35 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.52 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.2 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.82 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.43 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  30.47 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  32.22 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>