More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1784 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  62.25 
 
 		 563 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  65.18 
 
 		 568 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  62.61 
 
 		 564 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  65.61 
 
 		 568 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  62.25 
 
 		 563 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  68.69 
 
 		 567 aa  755    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  76.02 
 
 		 562 aa  822    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  74.01 
 
 		 575 aa  811    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  62.97 
 
 		 563 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  100 
 
 		 571 aa  1154    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  96.67 
 
 		 571 aa  1117    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.52 
 
 		 575 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  48.16 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  41.81 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 564 aa  438  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  34.74 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  33.22 
 
 		 568 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  32.92 
 
 		 548 aa  309  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  30.85 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  29.7 
 
 		 567 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  32 
 
 		 561 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 365 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 393 aa  213  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  33.76 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 567 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 567 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  25.66 
 
 		 565 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  26.68 
 
 		 565 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 378 aa  179  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  26.16 
 
 		 577 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 577 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  25.61 
 
 		 577 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  25 
 
 		 550 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  30.16 
 
 		 369 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  34.05 
 
 		 513 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.94 
 
 		 385 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  31.25 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 377 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  27.18 
 
 		 422 aa  125  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 418 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.38 
 
 		 470 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.12 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  30.03 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  26.79 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.33 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 384 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.16 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 		 394 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05729  putative diguanylate cyclase  39.04 
 
 		 323 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.45 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  39.5 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.84 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.61 
 
 		 391 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  22.96 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 303 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000121  response regulator  36.77 
 
 		 319 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.87 
 
 		 378 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 423 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  40.27 
 
 		 382 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.15 
 
 		 454 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  26.76 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  28.67 
 
 		 619 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  25.59 
 
 		 380 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.37 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  26.47 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.45 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25.59 
 
 		 380 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  41.23 
 
 		 1127 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  26.47 
 
 		 358 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  26.47 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  26.47 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  22.91 
 
 		 396 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  26.76 
 
 		 380 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  26.76 
 
 		 380 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.93 
 
 		 380 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1665  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.07 
 
 		 313 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 418 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.69 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.69 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 225 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.13 
 
 		 378 aa  97.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  36.23 
 
 		 302 aa  96.7  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.32 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 		 331 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  38.71 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 227 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 		 328 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 156 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.04 
 
 		 400 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>