100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44222 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44222  enhanced disease susceptibility 5-like protein  100 
 
 		 564 aa  1121    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44111  predicted protein  30.06 
 
 		 597 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44112  predicted protein  44.44 
 
 		 757 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28091  MOP(MATE) family transporter  28.07 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0057098  normal  0.084674 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54598  predicted protein  26.82 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.954409  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49843  predicted protein  34.68 
 
 		 675 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31926  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.07 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  26.17 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  24.02 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  34.8 
 
 		 449 aa  67  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  29.46 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  30.84 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  30.19 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  33.16 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  23.5 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  26.95 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 451 aa  57  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 436 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  29.8 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 455 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 455 aa  55.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  26.65 
 
 		 455 aa  54.7  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  23.91 
 
 		 436 aa  53.9  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 448 aa  53.5  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.97 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.97 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.97 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  27.96 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.03 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.62 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.62 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 450 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 458 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 461 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.04 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.42 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  24.92 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2297  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  30.4 
 
 		 454 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  28 
 
 		 459 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 453 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.33 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  27.57 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  27.23 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  27.01 
 
 		 481 aa  44.3  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 466 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  28.04 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  26.54 
 
 		 446 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  30 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  24.03 
 
 		 516 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87197  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.28 
 
 		 490 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 459 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  30 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 505 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 453 aa  43.9  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  26.24 
 
 		 446 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  30 
 
 		 441 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>