More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36142 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_36142  predicted protein  100 
 
 
320 aa  662    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36759  protein required for amino acid permease transport from the Golgi to the cell surface  46.01 
 
 
318 aa  295  6e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  45.34 
 
 
319 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01130  conserved hypothetical protein  45.96 
 
 
338 aa  268  7e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01335  protein transport protein (LST8), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09560)  42.06 
 
 
393 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.37 
 
 
696 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.48 
 
 
1454 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.63 
 
 
1247 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.22 
 
 
1523 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.38 
 
 
1364 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.58 
 
 
1652 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.57 
 
 
1196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 
1510 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.16 
 
 
1552 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.27 
 
 
1221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
1481 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 
1236 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.03 
 
 
1599 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 
1163 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.01 
 
 
930 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.86 
 
 
1557 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 
1188 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.58 
 
 
1193 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.56 
 
 
1242 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.71 
 
 
947 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.6 
 
 
1553 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.18 
 
 
677 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.29 
 
 
1363 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 
1164 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 
1686 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
740 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.71 
 
 
576 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.64 
 
 
1831 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.27 
 
 
1856 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.83 
 
 
676 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
1190 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 
577 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.44 
 
 
1188 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26 
 
 
1213 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.95 
 
 
1868 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.94 
 
 
1229 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 
1367 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.75 
 
 
1474 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
1878 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.5 
 
 
1330 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.61 
 
 
1416 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.91 
 
 
630 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.67 
 
 
919 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 
1161 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 
1161 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.77 
 
 
1205 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 
1176 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.7 
 
 
1901 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  27.6 
 
 
589 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.47 
 
 
540 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  26.91 
 
 
678 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.41 
 
 
505 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.27 
 
 
1217 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  28.34 
 
 
1117 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.88 
 
 
1789 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.58 
 
 
1807 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.18 
 
 
1617 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.96 
 
 
1348 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.29 
 
 
657 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1823 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.96 
 
 
1623 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.27 
 
 
642 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00305  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Dip2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02680)  25.98 
 
 
963 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140894  normal  0.864535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 
1858 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 
1240 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
698 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.03 
 
 
464 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1609 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
1311 aa  89.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 
578 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.83 
 
 
1760 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.1 
 
 
608 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 
1711 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.6 
 
 
1443 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.41 
 
 
1177 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  30.29 
 
 
434 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.98 
 
 
742 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.1 
 
 
1262 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.29 
 
 
737 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.69 
 
 
1304 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.82 
 
 
682 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28 
 
 
1280 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 
1190 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 
1016 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 
565 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 
1661 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.5 
 
 
1016 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.15 
 
 
1373 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.36 
 
 
1399 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.37 
 
 
1267 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 
687 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.96 
 
 
1208 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.13 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>