More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0240 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 760 aa  1537    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50.75 
 
 		 751 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50.88 
 
 		 751 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  34.75 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  34.43 
 
 		 763 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  31.23 
 
 		 739 aa  327  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  30.43 
 
 		 801 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  30.04 
 
 		 713 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  28.79 
 
 		 741 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  27.62 
 
 		 743 aa  219  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  27.39 
 
 		 684 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.01 
 
 		 750 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 778 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.32 
 
 		 742 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 740 aa  172  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.41 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.91 
 
 		 736 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.79 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 		 478 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 478 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  26.05 
 
 		 727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  22.99 
 
 		 722 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  22.15 
 
 		 780 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 726 aa  143  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.49 
 
 		 727 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.36 
 
 		 753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 730 aa  128  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 804 aa  127  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  25.8 
 
 		 464 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.72 
 
 		 790 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.72 
 
 		 803 aa  124  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.64 
 
 		 720 aa  124  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  24.03 
 
 		 795 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  23.44 
 
 		 731 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.98 
 
 		 727 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.84 
 
 		 803 aa  114  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.03 
 
 		 756 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.66 
 
 		 711 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  23.82 
 
 		 775 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  22.22 
 
 		 790 aa  108  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.95 
 
 		 496 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.08 
 
 		 778 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.48 
 
 		 736 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  21.91 
 
 		 755 aa  103  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.52 
 
 		 524 aa  103  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.28 
 
 		 235 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  21.84 
 
 		 796 aa  103  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 474 aa  103  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  29.97 
 
 		 529 aa  103  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 735 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.54 
 
 		 779 aa  101  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  30.54 
 
 		 521 aa  100  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.97 
 
 		 795 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  22.28 
 
 		 735 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  22.73 
 
 		 789 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.95 
 
 		 721 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  35.06 
 
 		 252 aa  98.2  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  20.39 
 
 		 743 aa  97.4  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  20.78 
 
 		 786 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  28.01 
 
 		 508 aa  97.4  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.11 
 
 		 240 aa  96.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.53 
 
 		 759 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  28.41 
 
 		 721 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  21.54 
 
 		 802 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  24.22 
 
 		 756 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.59 
 
 		 772 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  24.74 
 
 		 740 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  32 
 
 		 814 aa  95.1  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.57 
 
 		 774 aa  95.1  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  29.95 
 
 		 257 aa  94.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.18 
 
 		 624 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.98 
 
 		 780 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  22.59 
 
 		 800 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.59 
 
 		 739 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.59 
 
 		 739 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  21.34 
 
 		 741 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.59 
 
 		 739 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  29.84 
 
 		 232 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  30.32 
 
 		 211 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.87 
 
 		 741 aa  91.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.68 
 
 		 739 aa  91.3  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.07 
 
 		 741 aa  90.9  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.15 
 
 		 505 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  20.7 
 
 		 794 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.33 
 
 		 741 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.01 
 
 		 539 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 		 492 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.84 
 
 		 605 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  20.62 
 
 		 798 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  25.89 
 
 		 466 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  25.73 
 
 		 490 aa  89  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  21.71 
 
 		 802 aa  89.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  31.48 
 
 		 763 aa  88.6  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  22.84 
 
 		 783 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 738 aa  88.6  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.13 
 
 		 741 aa  88.6  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  26.42 
 
 		 753 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.34 
 
 		 747 aa  88.2  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  26.9 
 
 		 667 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 		 492 aa  88.6  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>