More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25041 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25041  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1110    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25071  hypothetical protein  68.26 
 
 		 615 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19271  hypothetical protein  55 
 
 		 693 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19291  hypothetical protein  56.15 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25101  hypothetical protein  52.47 
 
 		 669 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02081  hypothetical protein  55.81 
 
 		 102 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21531  hypothetical protein  80 
 
 		 70 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.6 
 
 		 1489 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  39.82 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  29.32 
 
 		 1769 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  37.84 
 
 		 2768 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 		 260 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.94 
 
 		 769 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  38.1 
 
 		 6753 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  40.82 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  52 
 
 		 4687 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  40.48 
 
 		 8682 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  40.48 
 
 		 9030 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.98 
 
 		 5218 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.34 
 
 		 2667 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  41.8 
 
 		 889 aa  63.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.62 
 
 		 4798 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.02 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  35.44 
 
 		 7284 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.81 
 
 		 980 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1835  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1845 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.69 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  41.57 
 
 		 1610 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.62 
 
 		 2542 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.19 
 
 		 2678 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  41.38 
 
 		 5442 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.31 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 7149 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  40.54 
 
 		 1156 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.02 
 
 		 1403 aa  61.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.14 
 
 		 2954 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  50 
 
 		 856 aa  60.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41 
 
 		 1795 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  39.64 
 
 		 1499 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.53 
 
 		 5962 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.65 
 
 		 1895 aa  60.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  36.36 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  42.35 
 
 		 4214 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  41.53 
 
 		 2689 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  43.82 
 
 		 4678 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  36.36 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47.5 
 
 		 5769 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.45 
 
 		 744 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.18 
 
 		 4220 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  36.64 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  44.12 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 946 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  44.58 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.74 
 
 		 2668 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  50.68 
 
 		 4334 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.86 
 
 		 5839 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.02 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.72 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  54.69 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  36.79 
 
 		 1534 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.09 
 
 		 1079 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  41.18 
 
 		 16322 aa  57.4  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 2107 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  35.82 
 
 		 2743 aa  57.4  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  38.74 
 
 		 460 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  44.59 
 
 		 2105 aa  57  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 1610 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  44.87 
 
 		 622 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  35.96 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  40.59 
 
 		 2097 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  54.55 
 
 		 940 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 		 303 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 795 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  42.42 
 
 		 858 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.25 
 
 		 1363 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  38.83 
 
 		 1287 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 		 2812 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  48 
 
 		 4836 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  39.18 
 
 		 1394 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  50.79 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  36.54 
 
 		 742 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  53.12 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.47 
 
 		 1236 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  36.45 
 
 		 303 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  37.01 
 
 		 1168 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11851  hypothetical protein  48.68 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.86 
 
 		 387 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  44.71 
 
 		 999 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  36.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  44.71 
 
 		 1480 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  44.16 
 
 		 424 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  41.76 
 
 		 833 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.95 
 
 		 3427 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>