More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2252 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  100 
 
 		 460 aa  920    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  35.4 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  37.89 
 
 		 345 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  36.53 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  29.53 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  40.5 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  29.18 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  31.89 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  27.6 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.36 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  30.41 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  28.88 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.53 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  27.38 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  27.38 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  25.8 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  28.37 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  27.7 
 
 		 377 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  28.12 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  29.03 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  29.46 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  34.93 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  36.71 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  28.45 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  29.88 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  28.53 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  28.53 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  28.53 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  32.87 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  28.01 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  30.03 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  28.01 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  32.94 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  27.89 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  29.46 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  29.75 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  29.46 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  29.75 
 
 		 385 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  32.14 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  32.14 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  28.87 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.14 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  26.06 
 
 		 385 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  27.89 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  28.09 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  31.35 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.58 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.35 
 
 		 595 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  31.3 
 
 		 380 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  28.49 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  28.49 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  31.91 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  28.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  31.91 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  31.91 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.58 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.69 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  34.83 
 
 		 381 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  25.42 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.37 
 
 		 359 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.49 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.88 
 
 		 601 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.15 
 
 		 359 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.68 
 
 		 681 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  23.3 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  26.69 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  28.27 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  28.85 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  28.33 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  25 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.94 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.43 
 
 		 650 aa  93.6  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  29.01 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.04 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  27.66 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  23.41 
 
 		 580 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  28.01 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  25.62 
 
 		 401 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.61 
 
 		 717 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  26.26 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  25.42 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.75 
 
 		 463 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  28.01 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.64 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  28.1 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  24.52 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  28.26 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.77 
 
 		 578 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.92 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  26.35 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.79 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.75 
 
 		 834 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  27.3 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>