228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36075 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  100 
 
 
447 aa  924    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  41.61 
 
 
979 aa  332  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  40.77 
 
 
517 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  40.82 
 
 
410 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  38.32 
 
 
607 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  30.23 
 
 
513 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  27.95 
 
 
555 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  24.69 
 
 
364 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  26.61 
 
 
494 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  24.74 
 
 
442 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.01 
 
 
479 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  25.48 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  28.37 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  23.93 
 
 
516 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  22.09 
 
 
483 aa  87.4  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  22.86 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  24.62 
 
 
623 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 
481 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  24.1 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  24.04 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 
480 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  25.08 
 
 
683 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  23.47 
 
 
513 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  22.22 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  21.36 
 
 
492 aa  69.7  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  23.36 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  23.24 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  23.24 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  24.22 
 
 
549 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  23.24 
 
 
513 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  23.15 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.42 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  22.54 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.53 
 
 
462 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  21.25 
 
 
576 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 
574 aa  64.3  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  23.86 
 
 
494 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  23.86 
 
 
494 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.12 
 
 
511 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  23.86 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  23.86 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 
586 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  24.15 
 
 
507 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  21.33 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  21.33 
 
 
586 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  23.6 
 
 
494 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 
588 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 
524 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  21.33 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  21.33 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  21.33 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 
555 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  21.33 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  23.22 
 
 
490 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  23.16 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  21.33 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  21.33 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  23.16 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  23.16 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  23.16 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  23.16 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 
703 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 
510 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  22.39 
 
 
495 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  22.9 
 
 
495 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  22.9 
 
 
495 aa  57  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  22.88 
 
 
627 aa  57  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  37.78 
 
 
758 aa  56.6  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  26.16 
 
 
555 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.63 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  20.67 
 
 
586 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  21.07 
 
 
496 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 
587 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  20.52 
 
 
586 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  23.4 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  21.45 
 
 
654 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  28.35 
 
 
488 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.52 
 
 
576 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 
481 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  22.96 
 
 
641 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.72 
 
 
815 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  22.75 
 
 
589 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 
487 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  35.14 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.37 
 
 
538 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 
644 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.62 
 
 
620 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 
537 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  24.4 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.05 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  19.49 
 
 
610 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  28.48 
 
 
515 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
575 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  29.08 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.59 
 
 
560 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>