176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35596 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_35596  ABC(binding protein) family transporter: iron compound  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.076386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  41.57 
 
 
297 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  39.89 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1836  periplasmic binding protein  37.93 
 
 
297 aa  111  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3164  periplasmic binding protein  38.73 
 
 
309 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  35.8 
 
 
304 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  32.95 
 
 
310 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0278  periplasmic binding protein  32.61 
 
 
296 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1084  periplasmic binding protein  35.33 
 
 
316 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
309 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0976  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
308 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0429383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3425  putative iron transport system substrate-binding protein  32.03 
 
 
310 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  33.14 
 
 
309 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
309 aa  91.3  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  30.51 
 
 
350 aa  90.5  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  29.94 
 
 
308 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  29.83 
 
 
317 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  28.41 
 
 
308 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0957  periplasmic binding protein  36.26 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00790982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  29.21 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2784  periplasmic binding protein  30 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.151329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1767  putative periplasmic substrate-binding protein  33.15 
 
 
296 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  28.41 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  29.82 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2366  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
318 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0233  putative periplasmic substrate-binding protein  30.18 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  31.36 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  29.94 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  28.66 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  30.64 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.29 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  23.16 
 
 
351 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  27.27 
 
 
672 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.44 
 
 
335 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.74 
 
 
316 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  26.4 
 
 
332 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.89 
 
 
288 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  29.05 
 
 
304 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0602  iron/cobalamin ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.9 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.29 
 
 
319 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
288 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.49 
 
 
342 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  26.49 
 
 
342 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  25.84 
 
 
269 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.34 
 
 
318 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  29.61 
 
 
312 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.29 
 
 
270 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.18 
 
 
331 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  27.87 
 
 
263 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  29.94 
 
 
264 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  25.95 
 
 
344 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
305 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.72 
 
 
379 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.8 
 
 
393 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.82 
 
 
317 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2895  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
264 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
660 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  27.22 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
317 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  27.43 
 
 
269 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  32.02 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  33.09 
 
 
288 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2668  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  29.38 
 
 
354 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.27 
 
 
315 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  29.71 
 
 
382 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.16 
 
 
338 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
336 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  23.86 
 
 
338 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  22.6 
 
 
318 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  26.09 
 
 
339 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
341 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4139  putative periplasmic substrate-binding protein  28.65 
 
 
318 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0990029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.24 
 
 
589 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  28.41 
 
 
326 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
332 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
362 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  29.44 
 
 
339 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  21.97 
 
 
335 aa  51.6  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.16 
 
 
337 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  28.41 
 
 
331 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
338 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  23.76 
 
 
296 aa  51.6  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.72 
 
 
354 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  25.54 
 
 
376 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.91 
 
 
483 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  24.16 
 
 
338 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.16 
 
 
338 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
328 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>