176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3724 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  100 
 
 		 332 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  43.56 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  44.84 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  42.23 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  39.71 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.29 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  37.58 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  35.84 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  38.76 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  34.98 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  39.2 
 
 		 660 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  38.76 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  36.33 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  38.44 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  34.98 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  38.79 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  36.27 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  37.37 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  38.97 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  38.97 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  38.21 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  38.28 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  37.37 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  36.65 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  34.77 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  31.52 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1967  periplasmic binding protein  30.37 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.492481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  31.89 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  31.96 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0879  membrane transport solute-binding protein  39.57 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2713  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound binding protein  39.57 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.77 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.854026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3912  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000229928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  28 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5102  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0139456  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2418  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3094  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239264  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3916  periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3256  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.16 
 
 		 393 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4224  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5390  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.210291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.53 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.53 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2601  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0806884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2275  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0441  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4081  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 367 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  25.55 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1298  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  22.71 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1362  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21280  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.78 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0758  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  22.58 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  29.22 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1136  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  30.91 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  30.91 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.3 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2101  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.81 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.93 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2752  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7224  periplasmic binding protein  21.86 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3773  periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0345  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  21.98 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>