269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  96.28 
 
 		 323 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  62.29 
 
 		 315 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  61.84 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  62.46 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  60.74 
 
 		 660 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  59.73 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  60.4 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  60.4 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  57.73 
 
 		 342 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  54.63 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  58.11 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  58.11 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  52.02 
 
 		 319 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  53.27 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  56.76 
 
 		 338 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  55.4 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  49.32 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  45.87 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  45.54 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0879  membrane transport solute-binding protein  58.93 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2713  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound binding protein  58.93 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  42.9 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  45.54 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  47.28 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  44.95 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  46.13 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  43.47 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  33.64 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  38.41 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1967  periplasmic binding protein  35.67 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.492481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  32.55 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  36.62 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  34.02 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  33.11 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.81 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.854026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  32.63 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  32.57 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  37.37 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  33.77 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0441  periplasmic binding protein  33.66 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  30.32 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.69 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  32.89 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  32.13 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  32.15 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  32.15 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3912  periplasmic binding protein  32.19 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000229928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4224  periplasmic binding protein  32.27 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2601  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0806884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  29.32 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  29.32 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2275  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  26.75 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1298  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3916  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3256  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.77 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3094  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239264  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2418  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2101  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5102  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0139456  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4081  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1136  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1362  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5390  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 341 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.210291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3773  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0758  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.27 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0880  membrane transport solute-binding protein  60.32 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.386332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2714  lipoprotein  60.32 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.15 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0993  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00265339  hitchhiker  0.0000000000789145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21280  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.87 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 478 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>