281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0592 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  100 
 
 		 315 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  61.36 
 
 		 316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  61.15 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  61.49 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  63.01 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  55.78 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  55.45 
 
 		 319 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  56.46 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  55.44 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  55.78 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  55.97 
 
 		 342 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  55.1 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  53.57 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  55.1 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  55.52 
 
 		 338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  51.6 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  54.39 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  45.97 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  42.49 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  43.55 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  42.26 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2713  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound binding protein  53.36 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0879  membrane transport solute-binding protein  53.36 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  41.16 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  44.29 
 
 		 350 aa  268  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  41.32 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  42.09 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  39.13 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  36.18 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  36 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  34.11 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  35.14 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.13 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  36.33 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1967  periplasmic binding protein  32.17 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.492481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  31.4 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  33.11 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  31.77 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  32.08 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.63 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.854026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  29.58 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2275  periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2601  periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0806884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2418  periplasmic binding protein  30.93 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3256  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.05 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3912  periplasmic binding protein  30.23 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000229928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0441  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3094  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239264  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4224  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5102  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0139456  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3916  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212593  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.96 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.96 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1362  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5390  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.210291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2101  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4081  periplasmic binding protein  27.38 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  26.44 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3773  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1136  periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1298  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 376 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0758  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  26.2 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2714  lipoprotein  61.67 
 
 		 69 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0880  membrane transport solute-binding protein  61.67 
 
 		 69 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.386332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21280  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.16 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.25 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.71 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.5 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.5 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  24.05 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>