39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2714 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2714  lipoprotein  100 
 
 
69 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0880  membrane transport solute-binding protein  100 
 
 
69 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.386332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  98.55 
 
 
660 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  98.55 
 
 
342 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  98.55 
 
 
342 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  98.55 
 
 
344 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  78.26 
 
 
338 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  76.81 
 
 
330 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  76.81 
 
 
330 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  76.81 
 
 
330 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  60.32 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  58.73 
 
 
323 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  61.67 
 
 
315 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  55 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  55 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  54.55 
 
 
342 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  46.67 
 
 
317 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  47.54 
 
 
350 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  46.15 
 
 
331 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  37.5 
 
 
319 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  45.61 
 
 
311 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  34.38 
 
 
317 aa  53.9  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  45 
 
 
338 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  43.86 
 
 
327 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
336 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  34.38 
 
 
338 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  44.62 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  41.82 
 
 
343 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  38.81 
 
 
338 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  32.35 
 
 
318 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
330 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  33.85 
 
 
320 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  37.5 
 
 
335 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  36.07 
 
 
328 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  36.51 
 
 
339 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  38.18 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  31.67 
 
 
321 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  38.18 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.13 
 
 
332 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>