207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2437 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  100 
 
 		 348 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  32.95 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  32.45 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  26.69 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.44 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.854026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0441  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  32.75 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.19 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0758  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  26.09 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  30.79 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  30.45 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21280  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.47 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  28.07 
 
 		 317 aa  99.4  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  30.4 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  30.45 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 355 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 660 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.17 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.43 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.06 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  31.95 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.55 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1362  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.53 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 316 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4224  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5102  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0139456  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  28.79 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5390  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.210291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2101  periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.87 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.87 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  28.25 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.3 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2601  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0806884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3916  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2275  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1967  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.492481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.81 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2418  periplasmic binding protein  25 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  25 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4081  periplasmic binding protein  30.37 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3773  periplasmic binding protein  29.27 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  32.37 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  23.01 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1298  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1136  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.29 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3094  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239264  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0879  membrane transport solute-binding protein  31.44 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2713  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound binding protein  31.44 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.73 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3912  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000229928  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>