220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1967 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1967  periplasmic binding protein  100 
 
 		 358 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.492481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3912  periplasmic binding protein  46.65 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000229928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  35.22 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.28 
 
 		 319 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  35.67 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  35.62 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  31.89 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  32.51 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  34.37 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  32.63 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  33 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  35.27 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  33.82 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  32.75 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  33.56 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  31.68 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.03 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.53 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  29.05 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.9 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 660 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 313 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  30.85 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  29.55 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  29.21 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  30.55 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.05 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.854026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  27 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.53 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1298  periplasmic binding protein  23.83 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0879  membrane transport solute-binding protein  28.89 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2713  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound binding protein  28.89 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2275  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2601  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0806884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0441  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  24.72 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3256  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.84 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3094  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239264  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4081  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  25 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  25 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  20.57 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4224  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2101  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2418  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5102  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0139456  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  22.76 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5390  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.210291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1362  periplasmic binding protein  21.53 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  25 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1136  periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3916  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  24 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  23.96 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.73 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  24 
 
 		 689 aa  56.6  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  25 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.48 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.27 
 
 		 682 aa  56.2  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  26.2 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.64 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 682 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.7 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>