266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3494 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  65.6 
 
 		 350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0278  periplasmic binding protein  58.11 
 
 		 296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1836  periplasmic binding protein  46.94 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3164  periplasmic binding protein  43.81 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3425  putative iron transport system substrate-binding protein  42.03 
 
 		 310 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  45.95 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  40 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  40.34 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  43 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  42.37 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  39.32 
 
 		 308 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1084  periplasmic binding protein  40.73 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  40.82 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  39.39 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  38.72 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0976  periplasmic binding protein  32.88 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0429383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1767  putative periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4139  putative periplasmic substrate-binding protein  40.59 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0990029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0957  periplasmic binding protein  37.59 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00790982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0233  putative periplasmic substrate-binding protein  34.72 
 
 		 283 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  28.03 
 
 		 672 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.78 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  34.15 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.72 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  30.41 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.25 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.19 
 
 		 517 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.42 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35596  ABC(binding protein) family transporter: iron compound  29.83 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.076386 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0602  iron/cobalamin ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.05 
 
 		 258 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.45 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 293 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.08 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.08 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.91 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.16 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.01 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.27 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  21.96 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.22 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  26.14 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  22.43 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.38 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.32 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.34 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.22 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  27.74 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  23.31 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  21.33 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  25 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0657  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.713656  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  25.09 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  23.34 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.13 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  22.62 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>