More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0241 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  49.49 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3164  periplasmic binding protein  47.75 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  43.96 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  40.96 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  42.32 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  42.41 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1084  periplasmic binding protein  43.54 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  43.3 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  41.3 
 
 		 308 aa  242  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3425  putative iron transport system substrate-binding protein  41.3 
 
 		 310 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0278  periplasmic binding protein  43.71 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0976  periplasmic binding protein  37.54 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0429383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  42.37 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  40.69 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4139  putative periplasmic substrate-binding protein  43.27 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0990029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  37.11 
 
 		 350 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1767  putative periplasmic substrate-binding protein  42.18 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1836  periplasmic binding protein  39.25 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0957  periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00790982  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  32.63 
 
 		 672 aa  165  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0233  putative periplasmic substrate-binding protein  35.31 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  31.63 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  33.91 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  32.31 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  30.64 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  30.72 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  31.42 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  29.63 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  29.63 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  32.88 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35596  ABC(binding protein) family transporter: iron compound  32.95 
 
 		 207 aa  109  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.076386 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  31.08 
 
 		 517 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.42 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  29.29 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.84 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.66 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0602  iron/cobalamin ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.19 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 269 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  30.41 
 
 		 255 aa  92.4  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.99 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  24.4 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  24.05 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.44 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  24.75 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.44 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.41 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.22 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  26.67 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2011  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0162028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25.59 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.68 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  25.7 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  25.7 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  25.7 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  25.7 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>