More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2011 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2011  periplasmic binding protein  100 
 
 		 269 aa  524  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0162028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  69.11 
 
 		 263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  66.29 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  60.23 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  57.59 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  57.75 
 
 		 292 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2366  periplasmic binding protein  53.61 
 
 		 283 aa  291  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2784  periplasmic binding protein  55.04 
 
 		 303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.151329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  58.4 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  58.8 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  57.6 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2895  periplasmic binding protein  56.4 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2668  periplasmic binding protein  56 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2790  periplasmic binding protein  55.2 
 
 		 259 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.578873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  56.25 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  54.69 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  54.69 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 351 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  33.2 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  33.17 
 
 		 321 aa  99  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 337 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 341 aa  95.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  30 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  31.64 
 
 		 338 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.13 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  30.29 
 
 		 338 aa  92  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  30.29 
 
 		 338 aa  92  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  35.43 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 379 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  29.18 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  31.73 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  30.35 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.94 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.27 
 
 		 478 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  31.3 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30 
 
 		 356 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  30.45 
 
 		 517 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.01 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.31 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.9 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0657  periplasmic binding protein  32.41 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.713656  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.24 
 
 		 483 aa  82  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.53 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  22.14 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  27 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.07 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  23.17 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0602  iron/cobalamin ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.68 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  31.76 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1134  periplasmic binding protein  24.41 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0216627  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  29.82 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1713  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.917384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.93 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  21.76 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.34 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.8 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  30.68 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  30 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>