More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2532 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3091  periplasmic binding protein  45.02 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  41.2 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  45.71 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  41.22 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1134  periplasmic binding protein  37.97 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0216627  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  44 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  43.5 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2246  hypothetical protein  44.49 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155088  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.24 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3150  hypothetical protein  44.13 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0893  putative periplasmic substrate-binding protein  45.6 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2103  hypothetical protein  44.31 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000719716  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2226  periplasmic binding protein  46.25 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1031  putative periplasmic substrate-binding protein  43.5 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.377319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2810  hypothetical protein  42.74 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2323  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 294 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4823  periplasmic binding protein  40.48 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  35.08 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3557  putative periplasmic substrate-binding protein  41.13 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00679911  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2040  hypothetical protein  39.34 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  32.63 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40.77 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.9 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  35.08 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  32.49 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  34.36 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1761  hypothetical protein  40.65 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396883  hitchhiker  0.00317212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  40.23 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  31.65 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  32.07 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  32.07 
 
 		 275 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  35.25 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  31.65 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0010  putative periplasmic substrate-binding protein  39.36 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.19 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  31.75 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  34.73 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  34 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  33.88 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  31.09 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  36.25 
 
 		 304 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  34.02 
 
 		 318 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  34.13 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0133  hypothetical protein  32.47 
 
 		 281 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.1 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0184  periplasmic binding protein  34.12 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  33.61 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  32.66 
 
 		 303 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 300 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0141  hypothetical protein  32.1 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  31.36 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0131  hypothetical protein  34.33 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.881561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  33.2 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  31.78 
 
 		 341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  29.8 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  32.81 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  32.81 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  32.81 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  32.81 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  32.81 
 
 		 332 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0100  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.72 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  32.81 
 
 		 310 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.04 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 351 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30.65 
 
 		 339 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0283  hypothetical protein  34.38 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.01 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  39.06 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.67 
 
 		 309 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 310 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 296 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2366  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  30.26 
 
 		 354 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  31.8 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.72 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  32.33 
 
 		 517 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  32.05 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.58 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  28.52 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  28.52 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>