223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4823 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4823  periplasmic binding protein  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2103  hypothetical protein  57.94 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000719716  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1031  putative periplasmic substrate-binding protein  55.78 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.377319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  53.7 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2246  hypothetical protein  56.22 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155088  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2040  hypothetical protein  54.85 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0893  putative periplasmic substrate-binding protein  56.02 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2810  hypothetical protein  54.73 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3557  putative periplasmic substrate-binding protein  52 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00679911  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2226  periplasmic binding protein  53.39 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3150  hypothetical protein  55.02 
 
 		 290 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1761  hypothetical protein  52.97 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396883  hitchhiker  0.00317212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0010  putative periplasmic substrate-binding protein  50.59 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  38.04 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  39.22 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  40.48 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3091  periplasmic binding protein  38.4 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  35.66 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  33.99 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  35.32 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1134  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0216627  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  33.59 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2323  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.83 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0131  hypothetical protein  30.22 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.881561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 300 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  31.16 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.87 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0184  periplasmic binding protein  32.05 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0283  hypothetical protein  28.96 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.21 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  35.44 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0100  hypothetical protein  30.35 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  29.27 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.8 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.97 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  32.13 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.97 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.97 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.97 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.97 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0141  hypothetical protein  27.52 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  27.47 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0133  hypothetical protein  27.13 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  31.73 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  31.69 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.77 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  30.36 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  33.02 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  32.7 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.07 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.56 
 
 		 309 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  30.29 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  29.02 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  28.93 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11530  hypothetical protein  29.95 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  31.78 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  34.58 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  31.63 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  30.24 
 
 		 287 aa  72  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  29.61 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  30.24 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  31.58 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  28.5 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.57 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.55 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  31.55 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  28.5 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  31.41 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  28 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>